Ο πυθµένας της θάλασσας της Αγίας Νάπας είναι ένας υπέροχος κόσµος, ιδιαίτερα στην περιοχή του Ακρωτηρίου Γκρέκο.

Οι θερµοκρασίες της θάλασσας που κυµαίνονται από 16ÕC τον χειµώνα σε 28 περίπου το καλοκαίρι, αποτελούν ένα “θερµόκλινο” σε βάθος 20-30 µέτρων.

Η παρουσία του θερµόκλινου επηρεάζει σηµαντικά την κάθετη κατανοµή της θαλάσσιας ζωής.

Οι πιο πλούσιες περιοχές από πλευράς ποιότητας και ποικιλίας ζωής βρίσκονται κάτω από το βάθος του θερµόκλινου το καλοκαίρι. Για τον υποβρύχιο επισκέπτη, η πανίδα του πυθμένα στα ρηχά νερά του Ακρωτηρίου Γκρέκο µπορεί αρχικά να είναι κάπως απογοητευτική αλλά σύντοµα ανακαλύπτει τα πολλά κρυµµένα θαλάσσια όντα, τα οποία είναι αυτόχθονα στην περιοχή. Πολλά χώνονται στην άµµο όπως διάφορα είδη αχινών και αστερίων, παπαγαλόψαρα, παγωνόψαρα κλπ. Στις ρηχές βραχώδεις περιοχές τα συνηθισμένα ψάρια είναι τα φαγκριά, οι γύλοι.

Κοντά στους βράχους µικρές αγέλες γενειοφόρων µπαρµπουνιών αναµοχλεύουν την άµµο για να βρουν µικροσκοπικές γαρίδες. Ακόµα πιο βαθιά τα λειβάδια (Pasidonia) δηµιουργούν ένα τυπικό Μεσογειακό θαλάσσιο τοπίο. Σ΄αυτά τα λειβάδια υπάρχει αφθονία και µεγάλη ποικιλία ψαριών περιλαµβανοµένων μικρών γύλων, φαγκριών, πέρκας, και σαλαχιού.

Πολλοί ισχυρίζονται ότι η πιο ενδιαφέρουσα περιοχή είναι εκείνη των βράχων στα βαθιά νερά που αρχίζει από το Ακρωτήρι Πύλας και καταλήγει βόρεια του Ακρωτηρίου Γκρέκο. Τα λεπτά λιθοθάµνια έρχονται σε έντονη αντίθεση µε τα τεράστια σκούρα σφουγγάρια. Τα σφουγγάρια είναι παντού, αστραφτερά και σχεδόν φωτεινά. Οι αξινέλλες σε όλα τα σχήματα και µεγέθη αψηφούν τον νόµο της βαρύτητας. Οι θαλάσσιοι γυµνοσάλιαγκες ισορροπούν ενάντια στο ρεύμα. Από σχισµές και σπηλιές, ακόµα και σε ρηχά νερά, κοκκινόσωµοι Ανθίες (Anthias) σε κρυφοκοιτάζουν και µοιάζουν σαν να ντρέπονται να βγουν έξω για να φωτογραφηθούν.